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Livre rigide Metagenomic Data Analysis par Suparna Mitra (anglais)

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Caractéristiques de l'objet

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ISBN-13: 9781071630716

Type: NA

Publication Name: NA

ISBN: 9781071630716

Publication Year: 2023

Format: Hardcover

Language: English

Book Title: Metagenomic Data Analysis

Author: Suparna Mitra

Item Length: 10in

Publisher: Springer

Genre: Science

Topic: Life Sciences / Microbiology, Life Sciences / Genetics & Genomics

Item Width: 7in

Item Weight: 37 Oz

Number of Pages: Xiii, 441 Pages

À propos de ce produit

Product Information

This volume describes different sequencing methods, pipelines and tools for metagenome data analyses. Chapters guide readers through quality control of raw sequence data, metagenomics databases for bacterial annotations such Greengenes, SILVA, RDP and GTDB, guide to 16S rRNA microbiome analysis and pipelines such as mothur, DADA2, QIIME2, whole genome shotgun metagenomics data analyses pipeline using MEGAN and DIAMOND, web service such as PATRIC, RDP, mothur, Kaiju, PhyloPythiaS, MG-RAST, WebMGA, MicrobiomeAnalyst, WHAM!, METAGENassist and MGnify: EBI-Metagenomics, MG-RAST Metagenomics Analysis. Then the chapters inform the readers regarding Third-generation sequencing (TGS) approaches as MinION sequencing and teaches use of Ubuntu Linux Virtual Machine configuration, clinical and environmental resistomes, use of FISH techniques and designing FISH probes, protocols for viral metagenomics, and comprehensive guideline for microbiome analysis using most used R packages. Written in the format of the highly successful Methods in Molecular Biology series, each chapter includes an introduction to the topic, lists necessary materials and methods, includes tips on troubleshooting and known pitfalls, and step-by-step, readily reproducible protocols. Authoritative and cutting-edge, Metagenomic Data Analysis: Methods and Protocols aims to be comprehensive guide for researchers to specialize in the metagenomics field.

Product Identifiers

Publisher

Springer

ISBN-10

1071630717

ISBN-13

9781071630716

eBay Product ID (ePID)

18058372349

Product Key Features

Book Title

Metagenomic Data Analysis

Author

Suparna Mitra

Format

Hardcover

Language

English

Topic

Life Sciences / Microbiology, Life Sciences / Genetics & Genomics

Publication Year

2023

Genre

Science

Number of Pages

Xiii, 441 Pages

Dimensions

Item Length

10in

Item Width

7in

Item Weight

37 Oz

Additional Product Features

Series Volume Number

2649

Number of Volumes

1 Vol.

Lc Classification Number

Qh447-447.8

Table of Content

From genomics to metagenomics in the era of recent sequencing technologies.- Quality Control in Metagenomics Data.- Metagenomics Databases for Bacteria.- Amplicon Sequencing Pipelines in Metagenomics.- A practical guide to 16S rRNA microbiome analysis in musculoskeletal disorders.- DIAMOND+MEGAN microbiome analysis.- Interactive Web-based Services for Metagenomic Data Analysis and Comparisons.- Application of High Throughput Sequencing (HTS) to Enhance the Well-being of an Endangered Species (Malayan tapir): Characterization of Gut Microbiome using MG-RAST.- Designing knowledge-based bioremediation strategies using metagenomics.- Nanopore sequencing techniques - A comparison of the MinKNOW and the Alignator sequencers.- MAIRA: protein-based analysis of MinION reads on a laptop.- Recovery and analysis of long read metagenome-assembled genomes.- Cloud Computing for Metagenomics: Building a personalised computational platform forpipeline analyses.- Artificial Intelligence in Medicine: Microbiome-based Machine Learning for Phenotypic Classification.- Tracking Antibiotic Resistance From the Environment to Human Health.- Targeted enrichment of low-abundance and uncharacterised taxon members in complex microbial community with primer-free FISH probes.- Assembly and Annotation of Viral Metagenomes from Short-Read Sequencing Data.- Assembly and Annotation of Viral Metagenomes from Short-Read Sequencing Data.- Metagenomics Data Visualisation using R.- Comprehensive guideline for microbiome analysis using R packages.

2023

Dewey Decimal

572.8629

Series

Methods in Molecular Biology Ser.

Dewey Edition

Illustrated

Yes

Description de l'objet du vendeur

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Numéro de l'objet eBay :386907915145

Dernière mise à jour : mai 20, 2024 00:36:41 HAEAfficher toutes les modificationsAfficher toutes les modifications

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Lieux exclus :

Adresses militaires ou navales, Alaska/Hawaii, Barbade, Biélorussie, Guadeloupe, Guyane française, Libye, Martinique, Nouvelle-Calédonie, Panama, Papouasie-Nouvelle-Guinée, Polynésie française, Protectorats des États-Unis, Russie, Réunion, Samoa, Ukraine, Venezuela

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